COⅠ基因简介

编码线粒体细胞色素 C 氧化酶亚基 1（Cytochrome c Oxidase subunit 1，简称 COⅠ）

COⅠ基因位于动物线粒体DNA（mtDNA）的重链（H 链）的 tRNA-Lyr基因与 tRNA-Leu 基因之间，长度约为 1.6 kbp，COⅠ与细胞色素氧化亚基 2 （COⅡ）和亚基 3（COⅢ）共同构成参与级联反应的细胞色素氧化酶的核心结构。COⅠ基因为中度保守序列且碱基替换率较高，因而可作为优良的分子遗传标记被广泛地用于海洋动物的种及种以上阶元的分类及系统进化研究中。

COⅠ基因的序列分析

COⅠ基因的核苷酸序列分析

COⅠ基因序列分析是通过比较各类群个体间同源基因或基因片段的核酸序列，从而构建分子系统进化树，推断各类群间系统进化关系。目前利用 COⅠ基因的核苷酸序列构建分子系统进化树应用的最为广泛。

COⅠ基因的氨基酸序列分析

通过分析海洋动物 COⅠ的氨基酸序列来构建分子系统进化树。其优点在于可以避免由于密码子第 3 位的摇摆性而造成海洋动物间系统进化关系的不准确性。目前利用 COⅠ氨基酸序列探讨各类群间的系统进化关系尚处于起步阶段。

COⅠ基因的 RFLP 分析

RFLP（Restriction FragmentLengthPolymorphism）即限制性片段长度多态性，提出作为标记构建遗传连锁图谱的 。其分析技术是利用已知的限制性内切酶消化不同类群的同源 COⅠ基因的 DNA 分子, 电泳后 , 再用 DNA 探针杂交并放射自显影 ,从而得到与探针同源的 DNA 序列酶切图谱, 根据得到的非常稳定且特异的种间差异条带图谱计算各类群间遗传距离, 从而构建系统发育树。目前基于 COⅠ基因片段的 RFLP 分析技术在海洋动物中应用的较少 。

参考文献

  • 毕相东,杨雷,侯俊利等.COⅠ基因在海洋动物分子系统学研究中的应用[J].水产科学,2008(02):105-108.